Een extra binding die kan ontstaan tussen moleculen zijn de waterstofbruggen. De positieve kant van het ene molecuul en de negatieve kant van het andere molecuul trekken elkaar aan. Waterstofbruggen worden gevormd tussen moleculen waar zich OH-groepen of NH-groepen bevinden. Om een waterstofbrug aan te geven in een structuurformule maak je gebruik van een stippellijn. De waterstofbrug zorgt ervoor dat de moleculen elkaar sterk aantrekken, waardoor het kookpunt hoog is.